Высшее учебное заведение было образовано в 1994, Мардан Баймурзаевич Сапарбаев (доктор педагогических наук, заслуженного работника культуры, академика Международной Академии педагогических наук, мастера спорта СССР, заслуженного тренера РК) году на базе научно-учебного центра Южно-Казахстанского института физической культуры, именовалось – «Южно-Казахстанский региональный гуманитарный институт» и имел лицензию на образовательную деятельность по двум специальностям: «070600- Финансы и кредит», «021600- Правоведение».
Основной целью создания института как частного вуза нового поколения стала подготовка высококвалифицированных специалистов, придерживаясь эффективной системы управления, используя передовые методы и технологии науки и образования.
Первым ректором ЮКРГИ была Садчикова П.В.
Основоположниками вуза были выдающиеся педагоги страны: д.ф.м.н. Ташимов Л.Т., д.ф.н. Бейсенов К.Ш., д.ю.н. Агдарбекова Т.Г.,к.и.н Подушкин Н.П., к.ф.н. Мынжасаров А.Ж. и др.
Первопроходцами по получению высшего образования в ЮКРГИ были всего 120 студентов.
С февраля 1996 года ректором института стал Шабанов Е.И.
С сентября 1996 года ректором ЮКРГИ назначена Сапарбаева Гульшара Сарсенгалиевна.
В 2000 году институт прошел государственную регистрацию юридического лица на ТОО «Южно- Казахстанский гуманитарный институт им. М. Сапарбаева».
В 2013 году Г.С.Сапарбаева стала Президентом ЮКГИ имени М.Сапарбаева, а ректором вуза стал Алдабергенов Бейбит Абдыхалыкович.
С 2015 года вузом стал руководить Онласынов Ерлан Зулматович.
Южно – Казахстанский Гуманитарный Институт им. М. Сапарбаева является лидером частного образования в южном регионе Казахстана. Институт позиционирует себя на рынке образовательных услуг, как современный институт, реализующий программы «бакалавриата», предоставляющий студентам социальный пакет по расширению доступа к получению качественных образовательных услуг.
Институт активно развивает международное сотрудничество с известными учебными заведениями и научно-исследовательскими центрами мира.
Партнерами вуза являются высшие учебные заведения Германии, Киргизии, Польши, России такие как:
• Международная Академия менеджмента и технологий (Германия);
• НОУ ВПО Юридический институт (г. Санкт-Перебург);
• Тамбовский государственный университет имени Г.Р. Державина (Россия);
• Институт математики и информатики ГОУ ВПО г. Москвы «Московский городской педагогический университет» (Россия);
• Минский институт управления (Республика Беларусь);
• Киргизский государственный университет им. И. Арабаева .
Большим достижением Южно-Казахстанского гуманитарного института им М. Сапарбаева является награждение почетным званием Золотого лидера Южного – Казахстана 1 степени за достижение в сфере образования ( 2010 г.).
По результатам ранжирования итогов ВОУД Институт занимает 1 место среди вузов ЮКО.
За более чем 20-летний период подготовлено свыше 12 тысяч высококвалифицированных специалистов для различных отраслей страны, которые своим беззаветным трудом вносили и продолжают вносить достойный вклад в развитие экономики государства.
Институт располагает необходимыми материально-техническими условиями для качественного проведения учебного процесса. Материально-техническое обеспечение включает необходимые учебные и вспомогательные площади для учебного процесса, достаточную инфраструктуру, обеспечение учебного процесса вычислительной и оргтехникой, достаточным количеством учебных материалов.
В институте обеспечивается современный подход к организации качественного учебного процесса. Согласно Государственной программе развития образования на 2005-2010 годы в 2006-2007 учебном году институтом был совершен переход к принятой в мировой практике кредитной системе обучения, главное достоинство которой состоит в более высоком уровне автоматизации управления учебным процессом, т.е. в использовании интерактивные форм и методов проведения занятий, внедрены инновационные технологии, используется зарубежный опыт, привлекаются известные ученые, профессоры. Обучающиеся имеют доступ к ресурсам АИС Platonus: электронный журнал, итоговые оценки, обмен сообщениями, онлайн-тестирование, транскрипт, ИУПС.
Серьезное внимание уделяется в институте организации культурного досуга молодежи, обогащению его содержания, то есть созданы условия для творческого развития личности студента. Богата и разнообразна культурная жизнь института. Сегодня в институте функционируют Комитет по делам молодежи, Альянс студентов Казахстана, ССиМО «Жасыл Ел», команда КВН, дебатные клубы: «Эрудит», «Қыран», «Томирис», «Ерікті жастар», кружки: «Жас әдебиетшілер», «Жас экономистер», «Школа молодых преподавателей», спортивный клуб «Марс», кукольный театр «Жас дәурен». Также в Институте действует старостат. Основными задачами его деятельности являются- информирование студентов об управленческих решениях и изменениях в ходе учебного процесса, координация учебной деятельности.